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分子对接 · Molecular Docking耐药感知对接工作台 · 平台第一道计算门槛
原型演示 · 示例数据
靶点PBP2a · S. aureus
结构1VQQ
口袋别构 P1 · 距活性位点 60 Å
突变已选 2

① 配体准备 Ligand Preparation

与 SwissDock 对齐的输入方式,并自动识别共价弹头、预计算参数化状态;批量模式为下游 HTS 预演。

输入方式

SMILES 直接输入支持单个或批量(每行一个)
绘制器 Sketcher输入、修改或检查分子
在绘制器中修改后将重新参数化,原文件坐标不再保留
文件上传SDF / MOL2 / PDB,单分子或多分子
含全部氢与 3D 坐标的文件将按原样处理,尽量保留原子命名
高级检索按名称 / PDB ID / InChI 检索小分子
检索结果给出的 SMILES 以 pH 7.4 质子化状态为准

批量模式

配体列表 · 准备状态