与 SwissDock 对齐的输入方式,并自动识别共价弹头、预计算参数化状态;批量模式为下游 HTS 预演。
默认继承已锚定的细菌靶点;原生支持 WT / 单突变 / 组合突变体,平台自动构建侧链并局部优化。
选择杂原子配体时请勿勾选化学溶剂(chemical solvent)组分。
已关联耐药突变位点(平台自动构建侧链并局部能量最小化,无需手动准备突变结构)
当前为别构任务:该位点距活性位点约 60 Å,结合可能通过构象调控而非直接竞争发挥效应;采样策略与结果解读标准已相应调整。
双引擎策略:Vina 快速通量优先,Attracting Cavities 精确构象优先;别构任务默认推荐 AC 并提高采样。
采样强度映射配体初始旋转角:低 180° / 中 90° / 高 60°。别构口袋通常更浅、更依赖构象调整,默认偏高采样;正构口袋默认中等。
每个 RIC 代表一组独立的随机初始构象与取向;RIC 越多采样越充分,耗时相应增加。
阈值越高仅检测较深的结合裂隙;取 50 时也会覆盖较浅的空腔,适合别构口袋探测。平台会预检参数,确保网格内存在吸引点且任务可在合理时间内完成。
提交前请检查参数汇总;服务器端执行,本地无需算力。任务将同步出现在平台任务流看板。
按最佳打分排序;同一配体同时对接 WT 与突变体时显示 ΔScore(突变体 − WT),数值越大提示耐药敏感性越高。
| 配体 | 最佳打分 (kcal/mol) | 引擎 | 靶点版本 | ΔScore | 聚类 | 相互作用 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| L-01 | −9.2 | AC | WT | — | C1 | 氢键 ×3 · π 堆积 ×1 |
| L-01 | −7.8 | AC | N146K/E150K | +1.4 | C2 | 氢键 ×1 |
| L-02 | −8.9 | Vina | WT | — | C1 | 氢键 ×2 |